O espaço educativo do museu é constituído por duas salas:
Sala de aula de cariz formal e apetrechada com quadro interativo, computadores e material de laboratório. Tem como finalidade a realização de atividades no decorrer das visitas de estudo.
Sala didática de cariz informal e equipada com jogos lúdico-didáticos. Pode ser utilizada como complemento às atividades desenvolvidas na sala de aula ou funcionar de forma autónoma na realização de jogos lúdicos com visitantes.