O Museu da Baleia da Madeira sempre se preocupou com a divulgação de informação sobre os cetáceos da RAM, tendo desenvolvido atividades educativas pontuais.
No entanto apenas no ano letivo 2007/2008, no âmbito das atividades consideradas no Projeto EMECETUS, co-financiado pelo programa de iniciativa comunitária INTERREG III B, foi possível desenvolver o programa educativo do Museu da Baleia da Madeira. O projeto contou com a colaboração da Secretaria Regional da Educação através do destacamento da professora Sílvia Mateus Carreira. Esta em colaboração com os biólogos Luís Freitas e Cláudia Ribeiro, do Museu da Baleia da Madeira, desenvolveram um conjunto de materiais de apoio aos Serviços Educativos do museu, nomeadamente:
1 - Dossier pedagógico;
2 - Fichas didáticas;
3 - Poster sobre a biodiversidade dos cetáceos;
4 - Mascote dos Serviços Educativos.
Os materiais 1, 2 e 3 foram apresentados e discutidos com os professores num evento que decorreu a 13 de Fevereiro no Hotel Dom Pedro – Machico.
O programa educativo foi, também, apresentado no âmbito da IWC (International Whale Commision) que decorreu no Funchal em Junho de 2009 .